平凡的小学三年生高町奈叶，为了帮助收集圣石之种而成为了魔法少女。在圣石之种事件中和菲特成为了朋友，在暗之书事件中和八神疾风成为了朋友，在StrikerS中已经是时空管理局魔导师、总局航空教导队教导官兼一等空尉。StrikerS中意识到自己内心真实心意的奈叶，救了下心中最爱之人高町薇薇欧，并对外收养其作为女儿。《魔法少女奈叶vivid》则讲诉了两人的日常。《魔法少女奈叶》系列是奈叶逐渐和一个个少女相遇并且最后成为了朋友和爱人的爱与勇气的物语。

第一季动画《魔法少女奈叶》描写高町奈叶成为魔法少女帮忙收集圣石之种以及菲特与奈叶成为朋友的经历。

第二季动画《魔法少女奈叶A's》描写八神疾风与奈叶和菲特成为朋友的经历。

第三季动画《魔法少女奈叶StrikerS》则描写长大后当上部队教官的奈叶等人对立志成为优秀魔导师的年轻孩子进行培养并一同守护和平的故事。奈叶在StrikerS中成功解决了JS事件，救下高町薇薇欧，并对外收养其作为女儿。

第四季动画《魔法少女奈叶vivid》以高町薇薇欧为主视角，讲诉其和奈叶的日常生活。截止到漫画94话，母女战高町薇薇欧对奈叶展开了激烈的攻势。

外传动画《ViVid Strike!》则以另一个少女风香·雷文顿为主人公讲诉了在次元世界的另一端米德切尔达的少女与少女爱意的故事。