魔法少女奈叶剧场版第三部又译《魔法少女奈叶The MOVIE 3rd Reflection》、《魔法少女奈叶3rd》，魔法少女奈叶剧场版第三部在3月23日召开的Lyrical Party 5活动中，剧场版《魔法少女奈叶3rd》宣布制作决定。

有一对负责研究“行星重生”的夫妇和两个女儿一起生活在Eltria（エルトリア）的世界中。当Eltria世界快接近于毁灭危机的时候，父亲不幸病倒了。两女儿之一的妹妹Kyrie Florian为了救助父亲和“行星重生”的研究，把希望寄托在了“遥远的异世界（遥か远い异世界）”上。而另一位大女儿Amitie Florian作为姐姐得知后就出面阻止Kyrie。最终来自Eltria世界的Amitie、Kyrie和Iris（イリス）等三人的行为一直影响到了高町奈叶、菲特·T·哈洛温、八神疾风等人所生活的世界“地球”上来了。