魔法老师剧场版全名《魔法先生Anime Final》，改编自赤松健连载于周刊少年Magazine的同名漫画，是06年SHAFT版《魔法先生》系列动画的完结篇，与漫画结局不同。故事舞台为日本的麻帆良学园，主角涅吉是在英国一间魔法学校修行的学生，年仅10岁便以首席毕业的天才，作为结业课题，他来到麻帆良学园担任国中部2年A班的教师，然而刚来到学园就被一名叫神乐坂明日菜的女生发现了魔法使的身份，自此开始了充满骚乱的校园生活。