超能奇兵剧场版全集故事讲诉的是21世纪初的日本，由于陨石撞击使得以横滨为中心地壳变迁，半径30公里的区域突然隆起，它从此以后被称为“里岛”。由于日本政府在此地实行的文明复兴计 划，使这个地方两极分化，这里的人被划分为住在复兴地区的重罪横行的外围地区“感染区”和拥有高度文明的中心地区“净化区”，而随着地壳变迁在“里 岛”1%的新生儿中开始出现了一个拥有拥有特殊能力的超能力者，他们可以在绝望中召唤出自己的心中的真武之神，因此被称之为分身使者，他们以这种能力不断 进行暴力和掠夺行为，由于分身不属于这个世界，而是动画片或是神话中的人物，所以他们的战斗能力在主人的想像中有多强，现实中就有多强，因此一时间整个日 本出现了前所未有的骚乱。为此，在“里岛”的政府机关内成立了一支以分身使者为成员的部队“圣堂”，以应对事态。在这样的背景下，在感染区成长的分身使者 卡斯玛与所“圣堂”的分身使者刘凤相遇了，故事也由此展开。