魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。 今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「國立魔法大學附屬第一高中」，某位少女將入學就讀。 容貌秀麗、完美無缺的優等生—— 她的名字叫「司波深雪」。 深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生， 優等生與劣等生的高牆…… 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹—— 深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。