在这世界反面存在着的，像镜子一样的不可思议的世界……「反转世界」。那里是只有基拉帝纳居住的特殊空间。以那反转世界为舞台，迪亚鲁加和基拉帝纳展开了激烈的战斗！为什么两只小精灵会战斗起来……。反转世界惊人的秘密究竟是！？在持续旅行的小智和皮卡丘一行人面前，出现了一只从未见过的小精灵。那是感谢小精灵谢伊米。可爱又少许傲慢的谢伊米身上，隐藏着某个秘密。旅行途中，从谢伊米遇到的危机开始，事态的发展变得超乎想象。这个世界与反转世界，为了拯救这两个世界，小智和谢伊米向最大的危机抗争！迪亚鲁加，基拉帝纳，雷吉奇卡斯，还有谢伊米。小精灵们的战斗如何发展！？被揭开的谢伊米的秘密，过去从未有过的冒险的高潮，和超越想象的“美丽的奇迹”将要下凡。